Z oceanu wyłoniły się nowe wyspy, a twoim zadaniem jako naukowca jest zbadanie nowych, ewoluujących ekosystemów. Obserwuj, jak wyspy na planszy rosną w trzech wymiarach, gdy dowiadujesz się o nich więcej i dodawaj kolorowe rośliny i zwierzęta do każdej wyspy, badając ich ekosystemy.

W Emerge zdobywasz punkty w każdej rundzie, rzucając kośćmi i wykorzystując je do prowadzenia badań i dokonywania odkryć. Wszyscy gracze zaczynają z tą samą planszą badawczą, ale w miarę postępów w grze możesz dostosować własną planszę i zmienić to, co badasz. Po ośmiu rundach punkty są przyznawane w zależności od tego, jak zamożne i bioróżnorodne są twoje wyspy, a także za różne cele badawcze.